양재동 세무사의 절세노트

직원 퇴직금 지급 시 반드시 해야 할 세무신고 ― 원천징수부터 신고기한까지 본문

5. 인건비와 원천세

직원 퇴직금 지급 시 반드시 해야 할 세무신고 ― 원천징수부터 신고기한까지

양재동세무사 2025. 8. 22. 19:00

퇴직소득세를 원천징수하더라도, 퇴직소득 지급명세서 제출은 별도의 신고 의무입니다.
이 의무는 원천세 신고와 독립되어 있으며, 제출하지 않으면 지급금액의 1% 가산세가 부과됩니다.
아래에서는 지급명세서 제출 기준과 함께 홈택스 제출 절차의 상세 구조까지 정리했습니다.

 

퇴직소득_지급명세서_1_표지
퇴직소득_지급명세서_2_제출대상
퇴직소득_지급명세서_3_제출기한
퇴직소득_지급명세서_4_홈택스절차
퇴직소득_지급명세서_5_실무팁

 

1️⃣ 퇴직소득 지급명세서란?

퇴직소득 지급명세서는 퇴직급여의 지급 내역을 국세청에 보고하는 자료로, 근거는 소득세법 제164조입니다.
퇴직소득세 원천징수 신고는 세액 납부 의무이고, 지급명세서는 퇴직자 정보를 제출하는 절차이기 때문에 각각 따로 진행해야 합니다.

 

국세청은 이 자료를 기반으로 퇴직자의 소득자료를 정리하여 종합소득세 자료연계, 건강보험 자격 판정, 근로내역 기록 등 행정처리에 활용합니다.즉 원천세 신고만으로 신고 의무가 충족되지 않습니다.


2️⃣ 제출 대상과 범위

퇴직금이 지급되면 사업 형태와 상관없이 모두 제출 의무가 발생합니다.

  • 제출 대상: 개인사업자·법인사업자 전부
  • 대상자: 국내 거주자(개인)에게 퇴직금을 지급한 경우
  • 금액 기준: 제한 없음(소액 지급도 제출)
  • 구성 항목: 주민등록번호, 지급일, 지급액, 원천징수세액, 비과세액 등

해당 자료는 종합소득세·건강보험의 행정 기반 자료가 되므로, 누락 시 가산세가 자동적으로 계산됩니다.


3️⃣ 제출 기한과 가산세

퇴직금 지급 시점에 따라 제출기한이 결정됩니다.

  • 일반 제출 기한: 지급연도 다음 해 3월 10일까지
  • 휴업·폐업: 휴·폐업일이 속하는 달의 다다음 달 말일까지
  • 가산세: 지급금액 × 1%
  • 3개월 내 제출: 가산세 50% 경감 → 지급금액 × 0.5%

계산 예시
퇴직금 3,000만원 지급 후 제출하지 않은 경우 → 30만원 가산세
3개월 내 제출 시 → 15만원


4️⃣ 원천세 신고와의 차이

퇴직금 지급 시 신고는 두 가지를 반드시 모두 해야 합니다.

 

구분 퇴직소득 원천징수 신고  퇴직소득 지급명세서 제출
목적 세액 신고 및 납부 지급 내역 정보 제출
제출 기한 지급월 다음 달 10일 다음 해 3월 10일
제출 여부 즉시 신고 별도 제출 필요
가산세 무신고·납부불성실 가산세 지급금액 1% 가산세

원천세 신고만 진행하고 지급명세서를 놓치는 경우가 많으므로 특히 주의가 필요합니다.


5️⃣ 홈택스 제출 절차

퇴직소득 지급명세서 제출은 홈택스에서 입력 방식으로 진행됩니다.
아래는 실제 절차를 단계별로 나누어 설명한 구조입니다.

 

✔ [1단계] 로그인

홈택스(www.hometax.go.kr) 접속 → 공동인증서·간편인증 중 선택하여 로그인.

 

✔ [2단계] 메뉴 이동

메뉴 경로는 다음과 같습니다.

[지급명세서 제출] → [퇴직소득 지급명세서 제출]

여기서 ‘근로소득 지급명세서’와 혼동하는 경우가 있으나 메뉴 위치가 다르므로 정확히 선택해야 합니다.

 

✔ [3단계] 제출 유형 선택

세 가지 항목을 입력해야 합니다.

  • 제출 구분: ‘정기’ 선택
  • 귀속연도: 퇴직금 지급일 기준
  • 제출연월: 실제 제출하는 달 기재

※ 실제로는 귀속연도 착오가 가장 흔한 오류로, 지급일이 12월인 경우 연도를 착각하기 쉽습니다.

 

✔ [4단계] 퇴직자 정보 입력(세부 입력 주의사항)

① 성명·주민등록번호 입력

  • 주민등록번호는 마지막 자리까지 정확히 입력해야 하며, 주민등록번호 오류 시 “체크디지트 오류” 메시지가 발생합니다.
  • 이 오류는 형식 불일치 또는 숫자 하나라도 잘못된 경우 나타납니다.

② 지급일 입력

  • 퇴직금 실제 지급일을 기준으로 입력
  • 지급일과 귀속연도는 반드시 일치해야 함

 

✔ [5단계] 검증 후 제출

‘검증하기’ 클릭 → 오류 여부 확인
오류가 없으면 ‘제출하기’ 클릭하여 제출 완료 제출 후에는 [제출내역 조회]에서 반영 상태를 반드시 확인합니다.


6️⃣ 제출 후 보관 및 정정 절차(간단 정리)

✔ 보관 기간

국세기본법 제112조에 따라 신고서류는 5년간 보관해야 합니다.

 

✔ 정정 제출 원칙

  • 동일 귀속연도에 대해 마지막 제출 건이 최종 반영
  • 제출 이후 오류 발견 시 ‘정기 제출’로 다시 제출하면 됨
  • 오류 수정 시 별도 가산세는 없음(이미 제출한 경우)

 

✔ 마무리

퇴직금 지급 시에는 원천세 신고뿐 아니라 퇴직소득 지급명세서 제출이 필수 의무입니다.
제출만 누락하더라도 지급금액의 1% 가산세가 바로 부과되므로, 매년 3월 10일 이전에 전년도 퇴직자 명단을 다시 확인하는 것이 필요합니다.

 

홈택스 입력 과정도 항목별 검증이 이루어지므로, 지급일·주민등록번호·원천징수세액의 불일치를 특별히 주의해야 합니다.
퇴직금 지급과 동시에 원천세 신고 및 지급명세서 제출까지 함께 처리하는 구조를 미리 갖추면 가산세 부담을 예방할 수 있습니다.

 

 

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